В АО «Организация «Агат» действует документально оформленная, внедренная и сертифицированная система менеджмента качества (СМК), распространяющаяся на выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ по вопросам экономической политики, экономики и управления ракетно-космической промышленностью в обеспечение формирования, обоснования и реализации федеральных целевых программ и программ международного сотрудничества по космосу, другим технико-экономическим и финансовым вопросам в обеспечение деятельности ракетно-космической промышленности, при создании и производстве космической техники, космических материалов и технологий, а также создании и реконструкции космической инфраструктуры, в соответствии с требованиями ГОСТ Р ИСО 9001-2015, ГОСТ РВ 0015-002-2020, а также других государственных стандартов СРПП ВТ, Положений РК-98, РК-98-КТ, РК-11, РК-11-КТ, ОСТ 134-1028-2012 изм. 2.
По результатам проведения первого планового инспекционного контроля сертифицированной СМК АО «Организация «Агат» Орган по сертификации систем менеджмента «СОЮЗСЕРТ» подтвердил действие сертификата соответствия СМК АО «Организация «Агат» № ВР 05.1.17700-2023 от 22.06.2023 г. (действителен до 22.06.2026 г.).
Приказом АО «Организация «Агат» от 28.04.2022 № 78 утверждена политика АО «Организация «Агат» в области качества (выпуск 5).
